Российские исследователи разработали стратегию создания дешевого и быстрого теста на COVID-19, основанного на изотермической амплификации. Согласно их публикации в Applied Biochemistry and Microbiology , использование этой стратегии позволит создать универсальные тест-системы для любого из вариантов COVID-19, пишет medicalxpress.com.
Существует несколько вариантов систем, которые обнаруживают следы SARS-CoV-2 в образцах крови или секрета человека. Обычно они обнаруживают либо обрывки РНК возбудителя COVID-19 с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) и ее аналогов, либо антитела к COVID-19.
Обычно для такого теста требуется довольно много времени, от 30 минут до нескольких часов, поэтому исследователи ищут новые, более быстрые методы обнаружения антител или инфекции COVID.
Юлия Макарова, доцент факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ, вместе со своими коллегами работает над другой альтернативой ПЦР-тестам, основанной на так называемой петлевой изотермической амплификации (LAMP). Такой подход к тестированию позволяет размножать определенные фрагменты ДНК или РНК из биологических образцов с использованием специальных маркеров и ферментов экстремофильных бактерий, обитающих в горячих источниках.
Ключевым преимуществом LAMP перед ПЦР является то, что все реакции можно проводить при одинаковой температуре. Это упрощает и ускоряет процесс. Но эти системы намного сложнее разработать и имеют несколько недостатков, которые ранее ограничивали их использование в тестовых системах COVID-19.
Российские исследователи разработали стратегию, которая поможет преодолеть эти недостатки и дать специалистам в области здравоохранения возможность использовать LAMP-тестирование для обнаружения следов любых вариантов COVID в образцах слизи и крови без предварительной обработки в лаборатории.
По словам доктора Макаровой, это значительно снизит стоимость тестов на COVID-19 и ускорит процесс, поскольку не потребуется ни специально обученных специалистов, ни дорогостоящего оборудования.
«Вирус довольно быстро мутирует, и тестовые системы, созданные год назад, могут оказаться не столь эффективными, как раньше. Мы анализируем мутации и ищем наиболее стабильные части вирусного генома. Это поможет создать тест системы, распознающие все существующие варианты и, что немаловажно, появляющиеся новые варианты », - сказала Юлия Макарова , доцент факультета биологии и биотехнологии НИУ ВШЭ. НИУ ВШЭ .
Чтобы решить эту проблему, биологи НИУ ВШЭ ищут части генома коронавируса, которые не сильно меняются с течением времени. Они будут служить маркерами, которые ферменты бактерий будут использовать для преобразования РНК COVID в ДНК и дальнейшего ее размножения. В сочетании с существующими компонентами системы LAMP они помогут создать универсальную систему тестирования COVID-19, которая сможет быстро обнаруживать следы любых вариантов COVID, заключили исследователи.
