Как только мы оседлаем омикронную волну, что дальше? Многие предполагали, что SARS-CoV-2, коронавирус, вызывающий COVID-19, эволюционирует в менее опасный вирус, потому что преобладающий в настоящее время вариант омикрон имеет тенденцию вызывать более легкую форму COVID-19. И хотя обычно именно так развиваются некоторые вирусы, они не всегда следуют этому образцу, пишет medicalxpress.com.
«От респираторного вируса мы ожидаем, что по мере того, как популяция вырабатывает иммунитет и вирус мутирует, со временем он обычно становится менее тяжелым», — говорит Ханна Барбиан, доктор философии, вирусолог и геномный эпидемиолог, изучающая SARS-CoV-2. для региональной инновационной лаборатории общественного здравоохранения в RUSH. «Но вирусы не всегда предсказуемы, и иногда могут быть мутации, которые делают неожиданные вещи».
Обнаружение следующего варианта в Чикаго
Несмотря на то, что трудно точно предсказать, как такой вирус, как SARS-CoV-2, изменится с течением времени, ученые все же могут отслеживать, когда он меняется. Это то, что они делают в RIPHL, работая в партнерстве с Департаментом здравоохранения Чикаго и другими местными больницами. Их работа помогает чиновникам общественного здравоохранения понять, какие варианты распространяются быстрее всего и какие сообщества больше всего затронуты, чтобы они могли принять меры для уменьшения распространения.Каждую неделю ученые из RIPHL проводят геномное секвенирование образцов COVID-19, собранных по всему Чикаго, для мониторинга циркулирующих в настоящее время штаммов и выявления новых штаммов SARS-CoV-2.
«RIPHL разработала стратегию эпиднадзора, которая, по прогнозам, позволит обнаружить новый вариант, присутствующий лишь в 2% образцов», — говорит Мэри Хейден, доктор медицинских наук, заведующая отделением инфекционных заболеваний Медицинского центра Университета Раш и со-главный исследователь RIPHL. . «Наша команда отслеживает глобальное появление новых вариантов, чтобы при необходимости изменять протоколы скрининга. Этот оперативный и гибкий подход дает нам наилучшие шансы быстро обнаружить важные варианты».
Они ищут мутации, именно так развиваются вирусы. Некоторые мутации в генетическом коде делают репликацию вируса невозможной, поэтому он не может развиваться. Но другие мутации могут сделать вирус более приспособленным для выживания. Это приводит к доминирующим вариантам, таким как омикрон, который по-прежнему отвечает за подавляющее большинство случаев COVID-19 в Иллинойсе.
«Мы секвенируем вирусы каждую неделю, поэтому у нас есть действительно актуальная информация о том, что есть в Чикаго, и отличается ли оно от других мест в стране или похоже», — говорит Барбиан. Во время омикронного всплеска различные пропорции в Чикаго отражали другие части страны.
Ответвление Омикрона?
На главный вопрос — когда возникнет новый штамм и свергнет омикрон как доминирующий вариант — ответить невозможно. «Мы не можем с уверенностью сказать, что новый будет появляться каждый год или каждые пять лет», — говорит Барбиан.Ученые точно знают, что изменения уже происходят с вариантом омикрон, который фактически разделился на два подварианта: BA.1 и BA.2. BA.1 является преобладающим штаммом, особенно в США. Но BA.2, имеющий другой профиль мутаций, в настоящее время циркулирует преимущественно в Европе и Азии.
Если BA.2 прибудет в Чикаго, Барбиан сможет обнаружить его с помощью разработанного ею теста, который называется быстрой высокопроизводительной ПЦР. В настоящее время неясно, отличается ли поведение BA.2, называемого в некоторых сообщениях СМИ «невидимым омикроном», несмотря на то, что его легко обнаруживают с помощью диагностических тестов SARS-CoV-2, от BA.1 с точки зрения его серьезности, трансмиссивности или способности к заражению. противостоять иммунитету.
Как варианты эволюционируют, чтобы стать доминирующими
Почему одни варианты превосходят другие? Барбиан объясняет, что мутации, которые наделяют вирусы повышенной трансмиссивностью или способностью уклоняться от ранее существовавшего иммунитета, могут дать некоторым вариантам «преимущество в приспособленности» над другими. В случае SARS-CoV-2 вирус обычно накапливает мутации медленно и предсказуемо с течением времени. «С омикроном явно была какая-то другая сила, которая влияла на эволюцию вируса», — говорит Барбиан. Одна из гипотез заключается в том, что омикрон вырос у пациента со слабой иммунной системой, у которого была длительная инфекция SARS-CoV-2, что создало возможность для вируса накапливать множество мутаций, поскольку он продолжал размножаться в организме.Еще одним фактором, который может повлиять на эволюцию вируса, является передача вируса от животного к человеку. Вирусы, особенно SARS-CoV-2, могут заражать не только людей, но и животных. По словам Барбиана, для этого вирус должен сделать некоторые адаптации, чтобы он мог расти в других видах. Например, SARS-CoV-2 может легко распространяться среди норок. «Он часто приобретает некоторые мутации, чтобы лучше развиваться у этого вида животных, а затем может передаваться обратно людям», — говорит она. Беспокойство заключается в том, что во время этого процесса вирус может получить некоторые мутации , чтобы он мог расти лучше, что может ускорить эволюционный процесс вируса.
SARS-CoV-2 как сезонный вирус
Хотя неясно, как будет развиваться SARS-CoV-2 в течение следующих нескольких лет, Барбиан предлагает обнадеживающий прогноз: вирус в конечном итоге станет менее тяжелым или сезонным, или и тем, и другим, как четыре сезонных коронавируса, которые вызывают около 20 процентов простудных заболеваний.Этот сдвиг будет происходить постепенно по мере роста иммунитета по всему миру. «Большая часть населения будет иметь какой-то иммунитет через вакцинацию или инфекцию, поэтому, если вы заразитесь новой инфекцией, у вас, вероятно, будет более легкая болезнь», — говорит она. «Конечно, новые варианты могут немного изменить ситуацию, но в целом, я думаю, мы к этому и движемся».
